21世紀(jì)。人類終于實現(xiàn)了與其他智慧生命體的接觸。但，這一相遇卻并非幸福之物。
　　從地冥界侵入的怪物，將大多數(shù)現(xiàn)代兵器無效化，人類的命運(yùn)如同風(fēng)中殘燭。
　　但在同樣為地冥界所苦的精靈環(huán)境條約機(jī)構(gòu)的協(xié)助下，人類獲得了起死回生的一著棋。那就是魔法少女。
　　獲得強(qiáng)大魔力的少女，即使在身心多處負(fù)傷的同時，仍然將人類引導(dǎo)向勝利，并終于使大戰(zhàn)結(jié)束。
　　但，這只不過是新的戰(zhàn)爭的開端而已。國際犯罪、無差別恐怖襲擊、內(nèi)戰(zhàn)、紛爭……。
　　魔法少女的戰(zhàn)斗沒有結(jié)束——